目前，国家卫健委负责管理食品用菌种名单，主要包括《可用于食品的菌种名单》《可用于婴幼儿食品的菌种名单》《可用于保健食品的益生菌菌种名单》和《可用于保健食品的真菌菌种名单》，以及新食品原料公告中批准的菌种。除以上名单中的菌种外，传统上用于食品生产加工的菌种允许继续使用。例如：冠突散囊菌使用范围为茶叶，属于《可用于食品菌种名单》中有关“传统上用于食品生产加工的菌种允许继续使用”的范畴。